Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Taf4bG5E8Z2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Taf4bG5E8Z2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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