Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Arfip1G5E8V9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arfip1G5E8V9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms