Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tubgcp6G5E8P0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tubgcp6G5E8P0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms