Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
2610008E11RikG3X964 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610008E11RikG3X964 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms