Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NpcdF8VQB8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NpcdF8VQB8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms