Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ScaperF8VQ70 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ScaperF8VQ70 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ScaperF8VQ70 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms