Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
D430041D05RikF6ZGR6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.8 ms