Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm10563F6WIE4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm10563F6WIE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms