Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933403O08RikF6UK53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4933403O08RikF6UK53 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms