Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DspE9Q557 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DspE9Q557 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DspE9Q557 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms