Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zfp558E9Q1J0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Zfp558E9Q1J0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp558E9Q1J0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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