Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syde2E9PUP1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syde2E9PUP1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms