Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Piezo1E2JF22 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Piezo1E2JF22 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms