Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Soga1E1U8D0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Soga1E1U8D0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms