Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
4930407I10RikD3Z5T8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930407I10RikD3Z5T8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms