Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms