Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc170D3YXL0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc170D3YXL0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms