Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26c1B2RXA7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26c1B2RXA7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms