Protein–RNA interactions for Protein: B2RWS6

Ep300, Histone acetyltransferase p300, mousemouse

Predictions only

Length 2,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep300B2RWS6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ep300B2RWS6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ep300B2RWS6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms