Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3lB2RV38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms