Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud7bB2RUR8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otud7bB2RUR8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms