Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1B2KF50 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uhrf1bp1B2KF50 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1B2KF50 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms