Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prr29B1ARI9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prr29B1ARI9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms