Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Skint5A7XUY5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Skint5A7XUY5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Skint5A7XUY5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Skint5A7XUY5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms