Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Skint2A7XUX6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms