Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Btbd35f28A2CFD5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Btbd35f28A2CFD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms