Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Patl2A2ARM1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms