Protein–RNA interactions for Protein: A2AQP0

Myh7b, Myosin-7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh7bA2AQP0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myh7bA2AQP0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myh7bA2AQP0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms