Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syndig1A2ANU3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms