Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FocadA2AKG8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FocadA2AKG8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms