Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prdm12A2AJ77 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Prdm12A2AJ77 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prdm12A2AJ77 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms