Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VirmaA2AIV2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VirmaA2AIV2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VirmaA2AIV2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VirmaA2AIV2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VirmaA2AIV2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VirmaA2AIV2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VirmaA2AIV2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms