Protein–RNA interactions for Protein: A2AHC3

Camsap1, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap1A2AHC3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Camsap1A2AHC3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Camsap1A2AHC3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Camsap1A2AHC3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms