Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Frmpd4A2AFR3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Frmpd4A2AFR3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms