Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnksr1A2A9K7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnksr1A2A9K7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms