Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Prdm16A2A935 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Prdm16A2A935 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms