Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm2A2A7B5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm2A2A7B5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm2A2A7B5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms