Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam71e1A1L3C1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam71e1A1L3C1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms