Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr589-202ENSMUST00000218483 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr589-201ENSMUST00000061055 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms