Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Capns2Q9D7J7 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms