Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm7463-201ENSMUST00000201541 547 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Snw1Q9CSN1 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms