Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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