Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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