Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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Tsr1Q5SWD9 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Tsr1Q5SWD9 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Tsr1Q5SWD9 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Tsr1Q5SWD9 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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Tsr1Q5SWD9 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Tsr1Q5SWD9 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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