Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Usp48Q3V0C5 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms