Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Trafd1Q3UDK1 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms