Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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