Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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