Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms