Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprmP28828 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms